2009, Jan 1- Rilevamento del tropismo HIV

454 Life Sciences, una Compagnia Roche, ha annunciato oggi che una squadra di ricercatori del BC Centre of Excellence in HIV/AIDS e l'Universita' della British Columbia, Canada hanno usato il Genoma Sequencer FLX system per monitorare le varianti di bassa frequenza dell'HIV in campioni umani in un recente studio.

Il background di questo studio di ricerca e' che la corretta determinazione del "tropismo HIV" e' critico per la somministrazione di una nuova classe di farmaci chiamati antagonisti CCR5 usati nel trattamento dell'AIDS. Il tropismo HIV si riferisce al tipo di cellule che il virus HIV infetta, come determinato dai cosi' chiamati co-recettori che il virus impiega per entrare nelle cellula. Determinare il co-recettore che un ceppo di HIV usa, sia CCR5, CXCR4 o una combinazione di entrambi, e' un componente critico del monitoraggio e trattamento dell'HIV.

I risultati preliminari dello studio hanno scoperto che i metodi convenzionali di genotipizzazione mancano di sufficiente sensibilita' per il rilevamento della variante CXCR4 che e' una controindicazione per la somministrazione di CCR5 antagonisti. Usando un sequenziazione profonda con il Genome Sequencer FLX system, i ricercatori sono stati capaci di quantificare le varianti a bassa frequenza associate con una scarsa risposta agli antagonisti CCR5 e determinare accuratamente il tropismo HIV in tutti i campioni individuali.